Một hệ thống thông tin quản lý là một cách tiếp cận mà một công ty sử dụng khi đưa ra các quyết định kinh doanh khác nhau. Chủ doanh nghiệp và người quản lý chịu trách nhiệm về các quyết định vận hành, kỹ thuật và chiến lược. Sử dụng một hệ thống thông tin giúp những cá nhân này thu thập các tài liệu thích hợp sẽ giúp họ đưa ra quyết định tốt nhất có thể. Trong khi các hệ thống này là thủ công trong những thập kỷ trước, công nghệ kinh doanh cho phép các công ty thực hiện các hệ thống điện tử. Một số nhược điểm có thể tồn tại khi sử dụng hệ thống thông tin quản lý trong một công ty.
Đắt
Cài đặt một hệ thống thông tin quản lý có thể tốn kém cho một công ty. Công nghệ thông tin trong khi ngày nay rẻ hơn so với những năm trước, có thể chi phí đáng kể, đặc biệt là cho các tổ chức lớn hơn.Các hệ thống này cũng có thể yêu cầu phí hỗ trợ hoặc nâng cấp liên tục, có thể thể hiện dòng tiền mặt cố định trong tương lai. Các công ty phải tạo ra một ngân sách để trả cho các mục này để đảm bảo hệ thống thông tin luôn cập nhật với công nghệ kinh doanh. Cố gắng tích hợp các hệ thống này với công nghệ hiện đang sử dụng cũng có thể làm tăng chi phí.
Bảo trì
Các công ty có thể cần phải thuê các cá nhân bảo trì để giúp giữ cho một hệ thống thông tin điện tử hoạt động trơn tru. Những cá nhân này thường cần kinh nghiệm trong các chức năng khoa học máy tính và các chủ đề kinh doanh khác. Điều này không chỉ làm tăng chi phí lao động, mà còn đòi hỏi đào tạo bổ sung và giáo dục liên tục cho những cá nhân này. Công nghệ kinh doanh có thể thay đổi thường xuyên, tạo ra một môi trường nơi các công ty phải có các cá nhân được đào tạo có thể bảo trì đúng cách máy tính, trang web, máy chủ và các thiết bị khác được sử dụng bởi hệ thống thông tin quản lý.
Không hiệu quả
Hệ thống thông tin quản lý có khả năng trở nên kém hiệu quả trong hoạt động của một công ty. Như với tất cả các hệ thống máy tính, hệ thống thông tin quản lý chỉ tốt như lập trình viên. Thu thập thông tin không quan trọng hoặc không quan trọng có thể trì hoãn các quyết định kinh doanh vì các nhà quản lý phải yêu cầu đầu vào bổ sung. Dành quá nhiều thời gian để lập trình lại hoặc sửa chữa các vấn đề cũng có thể làm tăng thời gian dành cho quá trình ra quyết định. Chủ doanh nghiệp và người quản lý cũng có thể cần đào tạo mở rộng về các hệ thống mới, tạo ra một đường cong học tập hy vọng sẽ giảm dần theo thời gian.
